Museets samling av båtar och föremål med anknytning till den sjöfart som har relation till Onsala är förlagd till den stora båthallen i huvudbyggnaden samt till det båtskjul som finns intill denna och som på ett fint sätt smälter in i omgivningen.

Det som först fångar uppmärksamheten i båthallen är en så kallad Petterssonbåt, byggd omkring 1930. Båten hade legat länge på land utan skötsel när den skänktes till. Det är därför en stor utmaning för det arbetslag som åtagit sig uppgiften att restaurera den. Båten är dock redan i sitt nuvarande skick mycket värd att se.

En äldre båt, som renoverats med varsam hand, är en Gavlajolle med en lång historia bakom sig. Jollen byggdes för cirka 100 år sedan och är fortfarande i segelbart skick.

En tredje farkost är en så kallad "norsk snipa" som är byggd 1938. Den har används för fiske i Onsalafjorden, till snipan hör ett antal fiskredskap som visar hur fisket gick till under gången tid.

Utöver båtar finns en samling båtmotorer, framför allt utombordare, dessa bör kunna få äldre besökare att tänka tillbaka på tider med avslitna startsnören och hårt jobb att få fart på motorerna. Den äldsta motorn är en Seagull från 1950. Ett nytillkommet föremål är en kanon från Lars Gathenhielms skepp Grefve Mörner som vänligen ställts till museets förfogande av Sjöfartsmuseet i Göteborg.

I båthallen kan man också sätta sig in i segelmakarens och repslagarens arbete och bekanta sig med båtbyggarens verktyg.

I båtskjulet, med sitt gräsbevuxna tak, finns en intressant samling bruksbåtar att se. Samlingen växer efter hand genom donatorers välvilja.